L'avant-centre gabonais, qui n'a pas participé à la séance d'entraînement programmée mercredi matin à Marseille, ne figure pas dans le groupe retenu par Gennaro Gattuso pour voyager à Athènes.
Selon une porte-parole du club, qui n'a pas donné plus de précision, il souffre d'une "gêne". Son cas n'inspire pas d'inquiétude particulière au sein du club.
L'absence d'Aubameyang vient s'ajouter à celle de Valentin Rongier, dont la blessure à un genou a été annoncée mardi soir par l'OM. Le milieu de terrain va être opéré et son absence pourrait être longue.
Pour sa part, Azzedine Ounahi, vctime d'un accident domestique, n'a pas été convoqué.